"e-Pulse", generado por los pensamientos y emociones humanas, se utilizó como fuente de energía para el dispositivo de apoyo a la IA "Sapotama". De las sombras de este notable desarrollo aparecen monstruos terroríficos. Los Digimon son seres vivos que evolucionan consumiendo e-Pulse. Tomoro Tenma se ve arrastrado a una experiencia extraordinaria tras conocer a Gekkomon, que aparece de repente de su Sapotama. Mientras convive con Kyo Sawashiro y otros miembros del equipo de cazarrecompensas "Amanecer Dorado", Tomoro renueva su determinación.